Antrasis pasaulinis karas
Okupavusi ir aneksavusi Lietuvą, Sovietų Sąjunga tęsė masines represijas. Buvo suiminėjami inteligentai, valdininkai, išformuota Lietuvos kariuomenė, dalis karininkų sušaudyti. 1941 m. birželio 14-18 d. pradėti masiniai Lietuvos gyventojų trėmimai į Sibirą. Vien per šias keturias dienas gyvuliniais vagonais nežmoniškomis sąlygomis į Sibirą buvo išvežta apie 18 tūkstančių žmonių, daugiausiai mokytojų, teisininkų, pasiturinčių ūkininkų.
1941 m. birželio 22 d. prasidėjus Vokietijos ir Sovietų Sąjungos karui, Raudonoji armija traukėsi iš Lietuvos. Abi priešiškos kariuomenės pirmosiomis karo dienomis terorizavo ir žudė Lietuvos gyventojus. Ypač žiauriai Raudonosios armijos buvo nukankinti keliasdešimt politinių kalinių Rainių miškelyje.
Pirmosiomis karo dienomis pogrindinė antibolševikinė organizacija - Lietuvių aktyvistų frontas - organizavo krašto gyventojų sukilimą. Jau birželio 23 d. buvo paskelbta Lietuvos nepriklausomybės atstatymo deklaracija ir Laikinosios Vyriausybės suformavimas. Sukilėliai užėmė ir kontroliavo didelę dalį Lietuvos teritorijos. Sukilėlių buvo apie 20-30 tūkstančių, iš kurių beveik 2 tūkstančiai žuvo kovose.
